科学技术研究院设3各部，共4个科室，分别是（一）基础研究部，部内设两个科室：基金项目管理科和基地建设与管理科；（二）科技合作与技术转移部，部内设科技合作科；（三）成果与信息管理部，部内设成果管理科。

各部门的主要职责分别为：

    （一）基础研究部

    1、基金项目管理科

----负责国家、省市各部委、厅局等政府部门和校内各类自然科学类科研项目的组织申报、过程管理、结题验收等工作，以及相关科研项目的经费管理工作。

2、基地建设与管理科

----负责依托学校建设的国家、省部、地方科研基地（创新团队）的协调、筹建、管理、统计，配合保卫处负责重点实验室安全管理等。

----统筹管理辽宁大学理工科校内研究院、科普基地等的筹建、协调、相关政策起草、机构建设、日常管理、统计等。

----负责省市科学技术协会相关工作。

----大仪网建设及大型仪器设备共享事宜。

----科研项目经费落账。

    （二）科技合作与技术转移部

    1、科技合作科

----负责专利事务管理。

----负责辽宁大学技术转移中心相关工作，对外推广转化我校科技成果。

----负责企事业单位委托、校地合作、校企合作等各类横向课题组织协调管理（包括辽宁大学兴科中小企业服务中心运营及横向项目管理）。

----统筹建立、管理辽宁大学在各地设立的城市研究院、城镇研究中心等校地合作项目。

    （三）成果与信息管理部

    1、成果管理科

    ----负责科技成果的鉴定、登记。负责各级各类科技奖励的申报、管理。

----负责学术交流活动、各类会议的组织管理与协调服务。

    ----负责校内科技论文等优秀科技成果收集及奖励发放。

    ----科技信息发布、上下公文传递及综合性工作报告、总结、规划等文件材料起草。

    ----科研项目经费审批及院内日常办公经费报销及其他日常办公室工作。

----负责教育厅信息中心科技统计，科技简报。

----负责沈阳市校长联席会议相关事宜。

----负责科技宣传以及科技管理信息化建设，院内相关网络日常管理及维护。

----内部事务和离退休人员事务、信访接待、院内工会、党支部工作和固定资产相关事宜。